Большинство браузеров, если не находят ни одного тега <link>, который соответствовал бы значку, то полагают, что у страницы нет собственного значка, и поэтому используют для неё стандартный значок страницы (свой для каждого браузера). Но Microsoft Internet Explorer и в таком безнадёжном случае всё ещё дополнительно пытается найти в корне сайта файл с кодовым именем favicon.ico, чтобы достать и использовать значок оттуда.

      Некоторые ленивые вебмастеры при виде такого поведения приняли решение отказаться от каких бы то ни было тегов <link>, просто создав по одному файлу favicon.ico на сайт, и покидав их в корень сайта. Это решение не было мудрым, поскольку использование тега <link> даёт три преимущества:

1. файл со значком можно назвать как угодно, а не только favicon.ico;
2. можно назначить много разных значков нескольким разделам сайта, а не только один и только всему сайту сразу;
3. главное, если значок не прописан в <link>, то его не увидит ни Мозилла, ни Феникс, ни Netscape, ни Konqueror — и вообще ни один браузер, кроме Microsoft Internet Explorer. А это глупо!

     В FAQ эхоконференции Ru.HTML.Chainik от 26 апреля 2002 года (а именно, в пункте 2.30) содержится рекомендация создать файл favicon.ico, кинуть его в корень вебсайта, а потом именно его и указывать внутри <link>. Рекомендация эта опрометчива, поскольку если потом возникнет надобность отменить для одной из страниц указание нестандартного значка, то просто убрать соответствующий <link> будет недостаточно: Internet Explorer продолжит по-прежнему успешно находить favicon.ico в корне сайта. Единственным выходом станет переименование файла favicon.ico и изменение кода вообще всех остальных страниц вебсайта, а не только той одной, для которой захочется отменить указание значка. Исходя из этих соображений, свои значки никогда не следует называть стандартным именем favicon.ico. Помимо всего прочего, оно ещё и плохо соответствует внешнему виду значка, описывая одно лишь его предназначение. Регистр слов «shortcut icon» не важен; их можно записывать как строчными, так и заглавными буквами.